Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTBP2P56545 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTBP2P56545 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms