Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SH3BGRP55822 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SH3BGRP55822 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms