Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXCT1P55809 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms