Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL23P55773 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL23P55773 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL23P55773 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL23P55773 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL23P55773 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL23P55773 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL23P55773 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCL23P55773 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCL23P55773 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCL23P55773 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCL23P55773 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL23P55773 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms