Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH4P55283 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH4P55283 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH4P55283 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH4P55283 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH4P55283 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms