Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP9P55211 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP9P55211 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP9P55211 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP9P55211 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP9P55211 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP9P55211 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms