Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFDNP55196 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFDNP55196 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFDNP55196 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFDNP55196 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFDNP55196 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFDNP55196 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFDNP55196 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFDNP55196 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFDNP55196 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFDNP55196 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AFDNP55196 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AFDNP55196 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AFDNP55196 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms