Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEMP55040 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEMP55040 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEMP55040 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GEMP55040 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEMP55040 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEMP55040 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEMP55040 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEMP55040 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEMP55040 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEMP55040 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GEMP55040 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GEMP55040 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GEMP55040 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GEMP55040 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GEMP55040 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GEMP55040 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GEMP55040 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GEMP55040 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms