Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB1P54762 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB1P54762 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB1P54762 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms