Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB4P54760 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms