Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATN1P54259 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATN1P54259 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATN1P54259 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATN1P54259 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATN1P54259 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATN1P54259 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATN1P54259 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATN1P54259 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms