Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRAP54198 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRAP54198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIRAP54198 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIRAP54198 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIRAP54198 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIRAP54198 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRAP54198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRAP54198 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRAP54198 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRAP54198 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRAP54198 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRAP54198 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIRAP54198 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRAP54198 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRAP54198 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRAP54198 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms