Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLNS1AP54105 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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