Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2A2P52657 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A2P52657 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A2P52657 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms