Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCNN1GP51170 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1GP51170 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms