Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPOLAP51003 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPOLAP51003 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms