Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK7P50613 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK7P50613 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK7P50613 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK7P50613 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK7P50613 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK7P50613 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK7P50613 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK7P50613 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms