Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPOXP50336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPOXP50336 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PPOXP50336 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPOXP50336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PPOXP50336 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PPOXP50336 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PPOXP50336 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPOXP50336 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPOXP50336 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPOXP50336 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPOXP50336 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms