Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRE11P49959 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRE11P49959 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRE11P49959 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRE11P49959 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRE11P49959 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRE11P49959 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRE11P49959 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRE11P49959 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRE11P49959 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRE11P49959 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRE11P49959 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRE11P49959 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MRE11P49959 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRE11P49959 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms