Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRPC1P48995 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRPC1P48995 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRPC1P48995 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRPC1P48995 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.2 ms