Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA4P48058 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA4P48058 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms