Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSN1S1P47710 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms