Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSKP43235 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSKP43235 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSKP43235 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSKP43235 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms