Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A4P43007 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A4P43007 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms