Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms