Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX1P40424 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX1P40424 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX1P40424 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBX1P40424 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBX1P40424 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBX1P40424 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBX1P40424 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX1P40424 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX1P40424 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX1P40424 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX1P40424 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX1P40424 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX1P40424 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX1P40424 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX1P40424 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX1P40424 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX1P40424 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX1P40424 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX1P40424 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms