Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM6P40199 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM6P40199 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms