Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF1P36956 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms