Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TGFBR1P36897 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TGFBR1P36897 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TGFBR1P36897 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms