Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1BP35680 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1BP35680 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms