Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN2P32314 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN2P32314 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms