Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA11P31270 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA11P31270 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms