Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA5P30532 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA5P30532 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms