Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGA1P29973 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGA1P29973 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms