Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DUSP1P28562 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms