Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN3P26045 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms