Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTX3P26022 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTX3P26022 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTX3P26022 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTX3P26022 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTX3P26022 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTX3P26022 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTX3P26022 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTX3P26022 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTX3P26022 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTX3P26022 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTX3P26022 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTX3P26022 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms