Protein–RNA interactions for Protein: P25296

CNB1, Calcineurin subunit B, yeast

Predictions only

Length 175 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNB1	P25296	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RRP36	YOR287C	903 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YOR318C	YOR318C	306 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	TOM5	YPR133W-A	153 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	CDC6	YJL194W	1542 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	THI22	YPR121W	1719 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	TIM54	YJL054W	1437 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.52	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RAD57	YDR004W	1383 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	UBP6	YFR010W	1500 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YDL183C	YDL183C	963 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	PRO3	YER023W	861 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	GAL83	YER027C	1254 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	COS6	YGR295C	1146 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	SAP30	YMR263W	606 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	SER33	YIL074C	1410 nt		3.51	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	PRP22	YER013W	3438 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YDL012C	YDL012C	324 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	APE2	YKL157W	2859 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RGP1	YDR137W	1992 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	MDL1	YLR188W	2088 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	CHD1	YER164W	4407 nt		3.5	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	BDP1	YNL039W	1785 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	GET3	YDL100C	1065 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ASC1	YMR116C	960 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.49	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ZRC1	YMR243C	1329 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	FMP10	YER182W	735 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	RPB3	YIL021W	957 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	OAR1	YKL055C	837 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YPL102C	YPL102C	303 nt		3.48	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	GZF3	YJL110C	1656 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YGR291C	YGR291C	222 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YLR194C	YLR194C	765 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ELO3	YLR372W	1038 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YOR289W	YOR289W	756 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YBR298C-A	YBR298C-A	222 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ENT1	YDL161W	1365 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	STV1	YMR054W	2673 nt		3.47	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.46	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.46	□□□□□ -1.85
CNB1	P25296	IDS2	YJL146W	1410 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	PHO13	YDL236W	939 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YER034W	YER034W	558 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	SPI1	YER150W	447 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	NSE1	YLR007W	1011 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	SSP120	YLR250W	705 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	ATP14	YLR295C	375 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	SER1	YOR184W	1188 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YPR059C	YPR059C	387 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	ATG14	YBR128C	1035 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	GGA1	YDR358W	1674 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.46	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	REB1	YBR049C	2433 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	HST1	YOL068C	1512 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	SOD1	YJR104C	465 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	snR17a	snR17a	333 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	UMP1	YBR173C	447 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YDR444W	YDR444W	2064 nt		3.45	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	ARF2	YDL137W	546 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	NAT3	YPR131C	588 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	snR37	snR37	386 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	BOI2	YER114C	3123 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	TRM11	YOL124C	1302 nt		3.44	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	APP1	YNL094W	1764 nt		3.43	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.43	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	SEC53	YFL045C	765 nt		3.43	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	TYW3	YGL050W	822 nt		3.43	□□□□□ -1.86
CNB1	P25296	FRA2	YGL220W	363 nt		3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.9 ms