Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2F2P24468 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2F2P24468 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms