Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRM1P23921 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRM1P23921 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRM1P23921 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRM1P23921 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRM1P23921 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRM1P23921 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRM1P23921 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms