Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRGP23470 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRGP23470 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
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