Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 32.1
RPS3P23396 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 32.1
RPS3P23396 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 32.1
RPS3P23396 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 510.6□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 32.1
RPS3P23396 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-37■■■■■ 32.1
RPS3P23396 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 32.1
RPS3P23396 HLA-G-206ENST00000478355 1525 nt20.95■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-207ENST00000478519 1175 nt19.79■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.79■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.79■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 RPA3-206ENST00000463632 793 ntTSL 511.74□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 32
RPS3P23396 RPA3-205ENST00000462723 989 ntTSL 28.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 32
RPS3P23396 ITIH3-207ENST00000467268 568 ntTSL 412.71□□□□□ -0.379e-11■■■■■ 32
RPS3P23396 GRN-203ENST00000585512 562 ntTSL 415.46■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 32
RPS3P23396 WDR12-208ENST00000478869 541 ntTSL 21.07□□□□□ -2.241e-12■■■■■ 32
RPS3P23396 MPDU1-217ENST00000578267 582 ntTSL 312.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 32
RPS3P23396 MPDU1-214ENST00000576066 491 ntTSL 38.52□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 32
RPS3P23396 MPDU1-225ENST00000584479 572 ntTSL 27.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 32
RPS3P23396 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 32
RPS3P23396 PHGDH-205ENST00000482968 1754 ntTSL 214.85□□□□□ -0.035e-9■■■■■ 32
RPS3P23396 GDF15-202ENST00000594925 294 ntTSL 314.96□□□□□ -0.014e-25■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 517.8■□□□□ 0.442e-14■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-14■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-14■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SERPINE2-207ENST00000454956 546 ntTSL 416.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SERPINE2-210ENST00000489065 563 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 VKORC1-208ENST00000498155 870 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 31.9
RPS3P23396 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-52■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MPDU1-226ENST00000585188 863 ntTSL 311.15□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MPDU1-205ENST00000570458 591 ntTSL 310.35□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MPDU1-221ENST00000581380 456 ntTSL 38.52□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MPDU1-218ENST00000579445 582 ntTSL 38.35□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 MPDU1-220ENST00000580834 714 ntTSL 58.01□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 SPNS1-206ENST00000564476 890 ntTSL 318.61■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 ISOC2-204ENST00000587226 854 ntTSL 516.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 ISOC2-205ENST00000589080 763 ntTSL 214.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 OAT-207ENST00000492376 620 ntTSL 32.19□□□□□ -2.065e-7■■■■■ 31.9
RPS3P23396 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 518■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 514.05□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 BCAP31-205ENST00000430088 570 ntTSL 28.27□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 31.9
RPS3P23396 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-12■■■■■ 31.8
RPS3P23396 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 31.8
RPS3P23396 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 218.67■□□□□ 0.582e-12■■■■■ 31.8
RPS3P23396 CAPNS1-208ENST00000589162 701 ntTSL 35.92□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 31.8
RPS3P23396 LDHB-202ENST00000396075 744 ntTSL 38.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 31.8
RPS3P23396 PGK1-204ENST00000477335 353 ntTSL 39.17□□□□□ -0.947e-23■■■■■ 31.8
RPS3P23396 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 CNPY2-205ENST00000547570 624 ntTSL 310.08□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 31.7
RPS3P23396 PHGDH-207ENST00000496756 508 ntTSL 212.97□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 31.7
RPS3P23396 RNF181-205ENST00000456023 559 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 RNF181-204ENST00000443647 535 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-250ENST00000637536 562 ntTSL 421.44■■□□□ 1.023e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-266ENST00000637946 913 ntTSL 518.32■□□□□ 0.523e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 CRELD2-206ENST00000450207 963 ntTSL 518■□□□□ 0.473e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-209ENST00000520051 667 ntTSL 517.27■□□□□ 0.363e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-244ENST00000637202 1634 ntTSL 516.54■□□□□ 0.243e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-215ENST00000635769 575 ntTSL 416.35■□□□□ 0.213e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-205ENST00000518087 918 ntTSL 516.26■□□□□ 0.193e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-252ENST00000637603 579 ntTSL 416.19■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-212ENST00000523593 586 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-264ENST00000637898 664 ntTSL 215.09■□□□□ 0.013e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-207ENST00000519468 746 ntTSL 313.89□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-226ENST00000636435 4611 ntTSL 210.38□□□□□ -0.753e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-259ENST00000637792 581 ntTSL 48.45□□□□□ -1.063e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-225ENST00000636299 543 ntTSL 47.16□□□□□ -1.263e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-260ENST00000637805 780 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 TMEM165-211ENST00000515591 1786 ntTSL 25.71□□□□□ -1.53e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-238ENST00000636828 3365 ntTSL 25.22□□□□□ -1.573e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 ASAH1-234ENST00000636715 1025 ntTSL 52.16□□□□□ -2.063e-11■■■■■ 31.7
RPS3P23396 CAPNS1-213ENST00000592354 690 ntTSL 212.93□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 31.7
RPS3P23396 HADHB-204ENST00000425035 696 ntTSL 49.57□□□□□ -0.889e-10■■■■■ 31.7
RPS3P23396 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 ZHX1-C8orf76-202ENST00000622816 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.04■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 31.6
RPS3P23396 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 31.6
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