Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HRCP23327 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HRCP23327 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
HRCP23327 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
HRCP23327 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
HRCP23327 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HRCP23327 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HRCP23327 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HRCP23327 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HRCP23327 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HRCP23327 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HRCP23327 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HRCP23327 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HRCP23327 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HRCP23327 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HRCP23327 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HRCP23327 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HRCP23327 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HRCP23327 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HRCP23327 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HRCP23327 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HRCP23327 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HRCP23327 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HRCP23327 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HRCP23327 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HRCP23327 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HRCP23327 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HRCP23327 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms