Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRHP20396 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRHP20396 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRHP20396 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRHP20396 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRHP20396 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRHP20396 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRHP20396 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRHP20396 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRHP20396 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRHP20396 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRHP20396 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRHP20396 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TRHP20396 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRHP20396 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRHP20396 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRHP20396 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TRHP20396 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRHP20396 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRHP20396 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRHP20396 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRHP20396 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRHP20396 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRHP20396 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRHP20396 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TRHP20396 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRHP20396 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRHP20396 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRHP20396 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRHP20396 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRHP20396 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms