Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A1P19634 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms