Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2CP19387 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2CP19387 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms