Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHCEP18577 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHCEP18577 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHCEP18577 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHCEP18577 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms