Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LBPP18428 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LBPP18428 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LBPP18428 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LBPP18428 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LBPP18428 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LBPP18428 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LBPP18428 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LBPP18428 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LBPP18428 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LBPP18428 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms