Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB5P18084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGB5P18084 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms