Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTPS1P17812 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms